Интернет-аптеки предлагают оплату банковскими картами, электронными деньгами и наличными при получении. Некоторые сервисы поддерживают оплату в рассрочку или по безналичному расчету для юридических лиц. Выбор способа оплаты зависит от предпочтений покупателя.